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近來,對HSV感染的使用的DNA鑑定診斷單純皰疹病毒 1和2,通過PCR囊泡和皮膚潰瘍或粘膜(結膜包括眼睛)(非常敏感,特異和快速的診斷方法)的材料。該方法可用於檢測腦脊液中的病毒。陰性結果並不能排除,因為短病原體繁殖週期(僅在20小時的上皮細胞)材料的PCR皰疹感染的調查可得早或晚服用。PCR陽性結果僅表示該病毒在人體的存在,而且正在進行的感染的活性載體之間不能區分。
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