南方印迹法(由 E. Southern 和 R. Davis 于 1975 年开发)是目前用于识别特定疾病基因的主要方法。该方法需要从患者细胞中提取 DNA,并用一种或多种限制性内切酶进行处理。将得到的片段进行电泳,使其按大小分离(较小的片段在凝胶孔隙中移动得更快)。然后将这些片段转移(重新印迹)到硝酸纤维素膜上,并在其上铺一层放射性标记的探针。该探针仅与互补序列结合。然后,利用放射自显影技术,确定所需基因组 DNA 片段在电泳图上的位置。
将标记的 DNA 探针或 RNA 制剂逐滴滴加到固体基质上,无需预先限制和电泳,这种杂交称为点杂交或槽杂交,具体取决于过滤器上 DNA 斑点的形状(分别为圆形或长方形)。