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“不同癌症的生长秘诀”:科学家如何找到共同的“节点”——从MYC到核糖体组装

 
阿列克谢·克里文科,医学审稿人
最近審查:23.08.2025
 
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21 August 2025, 18:29

《科学进展》(Science Advances)发表的一项研究利用海量数据集表明,从WNT/β-catenin和GLI到RAS/RTK/PI3K等多种致癌通路,都汇聚于相同的细胞生长控制“节点”。作者构建了一个多组学难题(ChIP-seq、单细胞转录组学、磷酸化蛋白质组学、化学蛋白质组学、代谢组学、功能测试),并确定了两个主要靶点:MYC转录程序和核糖体生物合成/翻译。此外,他们还鉴定出了一些特定的蛋白质,即“信号传导叉”——NOLC1和TCOF1,它们的作用和磷酸化对肿瘤细胞增殖至关重要。

研究背景

肿瘤在其“上层”分解方面极其异质——有些由RAS/RTK/PI3K加速,另一些则由WNT/β-catenin、激素受体或谱系转录因子控制。但它们都具有一个共同的表型:细胞开始生长和分裂,不受任何阻碍。因此,肿瘤学家长期以来一直在完善寻找不同致癌途径汇聚的“下层”节点的想法——与仅针对“上层”驱动因素进行精准打击相比,此类靶点可能具有更广泛的适用性,并且更能抵御耐药性。越来越多的数据表明,此类节点通常成为核糖体的生物合成和翻译控制点,即为生长及其相关的信号级联提供营养的“蛋白质工厂”。

在这幅图中,MYC,作为核糖体基因转录的主要调控因子之一,以及翻译装置的组成部分,占据着特殊的位置。MYC加速rRNA转录、核糖体组装,并将细胞代谢切换至“生长模式”,而致癌激酶级联(mTORC1等)则在翻译后微调相同的过程。这种“MYC + 激酶”二重奏,协同促进核糖体工厂和蛋白质合成,这在多种肿瘤中均有观察到,并日益被认为是治疗的一个弱点。

该工厂的关键“螺栓”是核仁蛋白NOLC1和TCOF1(糖蜜)。它们作为聚合酶I和修饰复合物的组装位点和衔接子,协调rRNA的合成和核糖体颗粒的成熟。它们的水平和磷酸化在致癌刺激下会发生变化;已知TCOF1突变在核糖体病(特雷彻·柯林斯综合征)中存在,并且TCOF1和NOLC1在许多肿瘤中表达增加——从三阴性乳腺癌到头颈部肿瘤。这就是为什么这些蛋白质越来越多地被视为增殖标志物和干预点。

《科学进展》杂志上的一项新研究正面驳斥了这一“共同节点”假说:作者构建了一个多组学难题——从ChIP-seq和单细胞转录组学到磷酸化和化学蛋白质组学——并表明多种致癌程序汇聚于MYC和核糖体环路,早期事件通过翻译后开关和核仁调控因子NOLC1/TCOF1进行。这种关注点从“上游”驱动因素到生长最终节点的转变,设定了一个切实可行的方案:测试同时作用于驱动因素和核糖体轴(Pol I/翻译起始/核仁因子)的组合,以更广泛地覆盖肿瘤旁路治疗。

为什么这很重要?

基因组目录中有数百个“癌症基因”,每种肿瘤类型都喜欢“自身”的突变。但它们的表型却惊人地相似:细胞无限生长和寿命延长。这项研究为这一悖论提供了一个合理的答案:不同的驱动因素踩下了生物合成的同一踏板,增强了核糖体工厂的功率和翻译的启动,同时也协同启动了MYC。这意味着,与其追逐数十个“上游”驱动因素,不如同时瞄准可能与多种肿瘤相关的常见下游节点。

这是如何测试的?

该团队将致癌转录因子(ER、AR/ERG、TCF4/β-catenin、GLI/PAX3、FLI1等)的直接靶点与表达数据和GWAS关联进行了比较。他们同时发现:

  • 用细胞抑制激酶抑制剂处理细胞,并使用 scRNA-seq 过滤掉细胞周期停滞之前发生的变化;
  • 在早期时间点(≤2 小时)进行磷酸化蛋白质组学研究,以捕捉快速的翻译后事件;
  • 使用 PISA(蛋白质溶解度测定)记录复合物的重排;
  • 通过竞争性基因组编辑(CGE)确认了关键位点和启动子的功能。结果到处都一样:共同点是MYC程序+核糖体/翻译,多个调控因子的磷酸化领先于转录波。

主要发现如下:

  • MYC 是一个常见的转录“枢纽”。不同的致癌转录因子 (TF) 汇聚在一起,激活 MYC 和 CDK4/6;这从 ChIP-seq 和 GWAS 信号 (MYC、CDKN2A/B) 中均可见一斑。
  • 早期信号通过核糖体。2小时后,核糖体生物合成和剪接蛋白的磷酸化就会发生变化;在“敏感”细胞中,转录效应会较晚出现。
  • NOLC1 和 TCOF1 是增殖的标记物和调节器。它们的水平和磷酸化“标记”了真实肿瘤(舌鳞状细胞癌)中的增殖区域,而这些蛋白质中调控位点及其 MYC 结合位点的突变会破坏细胞的适应性。
  • 致癌基因的合作有一个生化解释:最佳生长激活需要在相同的核糖体节点上增加表达(通过 MYC)和精确的翻译后调节(通过激酶级联)。

NOLC1/TCOF1“节点”的新特性

传统上,这些核仁蛋白因参与rRNA合成和核糖体组装而闻名。本文表明,它们不仅是工厂活动的标记,而且是信号的汇聚点:

  • 它们的转录是 MYC 的一线靶点之一;
  • 当致癌激酶被阻断时,它们的磷酸化会迅速且协调地发生变化;
  • 磷酸化位点的突变破坏了 CGE 检测中的增殖优势;
  • 在肿瘤组织中,它们“勾勒出”了增殖区。所有这些使得NOLC1/TCOF1成为生长活性的通用生物标志物和潜在治疗靶点的候选者。

核糖体、代谢和生长:常见场景

除了核糖体分支外,作者还在代谢酶中发现了早期磷酸化信号(例如,在己糖激酶HK2中,Y461对生长的关键性通过点编辑得到证实)。该观点认为,生长是核糖体“硬件”和代谢燃料供应的同步加速,并通过“MYC +激酶”连接进行协调。

为什么诊所和制药公司需要这个?

如果不同的致癌基因被吸引到相同的下游过程,这将开辟三个实际方向:

  • 组合策略:针对“上游”驱动因素(EGFR/MEK/PI3K)和通路汇聚的核糖体/翻译连接点(例如通过调节翻译起始、Pol I/核糖体生物合成、NOLC1/TCOF1连接点)。
  • 增殖生物标志物:NOLC1/TCOF1 作为组织学和蛋白质组学中活跃肿瘤“工厂”的指标。
  • 抗性的解释:即使一个驱动因素受到抑制,细胞也可以“切换”到平行的激酶分支,但出发点仍然相同 - 核糖体/翻译→“额外”命中的目标。

界限在哪里?下一步是什么?

这是一项强有力的临床前研究,仅在一种代表性癌症类型中进行了人体组织验证。下一步工作显而易见:(1) 在其他原发性肿瘤和人源化肿瘤异种移植 (PDX) 模型中验证淋巴结;(2) 测试哪些药物干预措施(Pol I、eIF 淋巴结、rRNA 调控因子)与靶向治疗具有协同作用;(3) 将 NOLC1/TCOF1 扩展到临床组,并观察其与治疗反应和生存期的关联。

简要回顾——需要记住的三个论点

  • 不同的致癌基因 - 常见的“下游”靶点:MYC 程序、核糖体组装和翻译。
  • NOLC1/TCOF1 是增殖的关键节点:无论是转录还是磷酸化,以及在肿瘤组织中。
  • 致癌合作是可以解释的:在同一核糖体回路上表达(MYC)+磷酸化(激酶)。

来源:Kauko O. 等人。多种致癌基因利用共同机制驱动主要人类癌症的生长。 《科学进展》,2025年8月20日,11(34): eadt1798。DOI :10.1126/sciadv.adt1798

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